拥有利休喜爱的庭院的智积院

智积院是真言宗至山派的总部。在纪州的根来寺的寺院开始的。根来寺由于势力很大的原因和丰臣秀吉对立。天正13年（1585）由于根来寺所在的根来山遭到讨伐全部被烧毁，智积院的玄宥僧正逃到了高野山。丰臣秀吉死后，在庆长3年（1598）决定将智积院在京都重新振兴。
庆长6年（1601），从德川家康处得到了丰国神社的一部分并且重新振兴。大坂夏的阵的原因丰臣家全灭以后，丰臣秀吉为了祭奠淀君的长子鹤松的菩提而建立的祥云禅寺也被捐献，正式名称也变更为“五百佛山根来寺智积院”。明治33年（1900）将过去在智积院学习过的全国约3000家寺院召集起来，把智积院决定为大本营。
金堂是在明治15年（1882）烧毁后，1975年（昭和50）重建的建筑。主佛是大日如来，地上和地下各放置了一尊。
平成7年（1995）本来用作讲堂（方丈殿）的祥云禅寺的法堂也被重建了。
位于大书院东侧的名胜庭园原本是桃山时代的祥云禅寺的庭园。是运敞僧正在延宝7年（1674）将其修复的。在拥有模仿中国卢山的假山的池泉回游式庭园中，也有“利休喜好的庭院”的标语。据说祥云禅寺的庭院设计师是小堀远州。
祥云禅寺时代描绘的障壁画，长谷川等伯的“枫图”和儿子长谷川久藏的“樱图”在收藏库展示。大书院中装饰的是复制品。