拥有青不动明王像和三个庭园的青莲院

青莲院最早是最澄和尚在比睿山延历寺所建的青莲坊。
平安时代末期，行玄主持的时候被迁移到京都，成为了青莲院。之后，鸟羽上皇的第七皇子最为主持进入青莲院，自此青莲院成为了门迹寺院（由皇室成员及皇室相关者担任主持的皇家寺院）。
亲鸾圣人在因被《愚管抄》记载而为人所知的第三代主持慈円的主持下剃度出家，与净土宗渊源颇深。寺庙境内的植发堂供奉着亲鸾圣人剃度时的头发。
伏见天皇（1287～1298期间在位）的皇子第十七代尊円法亲王开创了书法的青莲院流派，并运用于公家文书。
之后，室町幕府的第六代将军足利义教，也曾用义円这个名字在此度过了自己的僧侣时代。本愿寺还是末寺的时候，莲如曾在此剃度。
田明8年（1788年），京都御所遭遇火灾时，青莲院被用作后樱町上皇的临时住处，因此有了粟田御所的别称。江户时代被德川家没收到知恩院旗下，现在仍有着1万坪（坪为日本面积单位，1坪约等于3.306平方米）的面积。
室町时代由相阿弥见到的庭院，借景了粟田山，是以龙心池为中心的池泉回游式庭园。
小堀远州所建的雾岛之庭，初夏和秋天的时候分别可以看到美丽的杜鹃花和红叶。
明治26年（1893年），由于火灾，青莲院大量的建筑被烧毁。
宸殿原本是东福院门（后水尾天皇的女儿）的住处迁移至此而建的，这之后历经了复兴。由于是亲鸾圣人剃度的地方，宸殿又叫剃度殿（お得度の間）。
青色的不动明王像——青不动明王二童子传说可以消除世人心中的疑惑和犹豫，庇护世人，是日本三大不动明王像之一。本堂的后堂里供奉着青不动明王二童子的复制品。